Tutorial Aplikasi Gamgi Dalam pembelajaran kimia

Gamgi

GAMGI adalah sebuah perangkat lunak open source untuk penciptaan dan analisis struktur atom.GAMGI (General Atomistic Modelling Graphic Interface) adalah sebuah program untuk

membangun, melihat, dan menganalisis strucures atom seperti molekul, kristal, gelas, cairan, dll.Nah sekarang yuk kita belajar cara menggunakan aplikasi GAMGI.

Buka aplikasi menu gamgi  maka akan terlihat tampilan di bawah  ini 

Jangan khawatir tidak bisa menggunakan apliksai Gamgi, karena di dalam aplikasi ada menu tutorialnya. Untuk memunculkan menu tutorial, klik Help-Tutorial, maka muncul

 

Nah saya mencoba untuk membuat bentuk kristal NaCl. Tutorial yang tampak adalah:

 

Dengan Tutorial tersebut sedikit membantu kita dalam pembuatan struktur NaCl

Untuk membuat cell maka kita harus klik bawah ini. Isi sesuai dengan cell-create-. Maka akan muncul tampilan seperti di tutorial 

Sedangkan untuk tampilan “atom-create” muncul tampilan seperti dibawah ini. Untuk mengisi data-data tersebut. Anda harus klik table:

Setelah Anda Klik Table maka muncul tampilan seperti di bawah ini. Pilih ataom Na 

tampilan yang akan muncul adalah seperti di bawah ini

Nah, ikuti langkah yang ada di menu Tutorial ya…

Untuk lebih jelasnya mari kita kunjungi alamat ini

http://www.ziddu.com/download/23434359/CARAMENGGUNAKANAPLIKASIGAMGI.docx.html

Tutorial Aplikasi Gnome Crystal Dalam Pembelajaran Kimia

Gnome Crystal

 

Apa itu Gnome Crystal? Aplikasi Gnome Crystal adalah aplikasi membuat sturktur atom dengan 3D.

Inilah tampilan awal Gnome

 

Pertama-tama klik Crystall lalu pilih Bonds and Lines, di situ ada beberapa pilihan antara lain Cell edges radius, Diagonals radius dan Medians radius semuanya dalam bentuk pm

 

Cell edges radius = jika kita centang dan mengetik angka, maka akan di hasilkan kerangka 3D

Diagonals radius = jika kita mencentang juga dan mengetik angka, maka akan dihasilkan kerangka dalam bersilang.

Medians radius = jika kita mencentang dan mengetik angka, maka akan dihasilkan kerangka lurus dalam.

Perhatikan gambar berikut.

 

Langkahnya, klik Cell edges radius dan ketik angka 7

lanjut…..ke gambar ke-2

 

kalau gambar di atas, pilih dan klik Cell edges radius dan ketik angka 4

the last….gambar ke-3

 

kalau yang ini pilih dan klik Cell edges radius dan ketik angka 1

Diagonals radius klik dan pilih angka 1

Medians radius klik dan pilih angka 1 juga.

Demikian, semoga dapat bermanfaat yaaa :)

Tutorial Aplikasi Easychem Dalam Pembelajaran Kimia

  Easychem

 

Easychem chemical structure editor adalah aplikasi untuk menggambar struktur 2D ikatan kimia. Instalasi bisa langsung lewat Ubuntu Software Center. Aplikasi ini sangat mudah digunakan, disediakan fungsi Help untuk format penulisan senyawa-senyawa kimia dari yang sederhana hingga yang kompleks. Dari ikatan tunggal, ikatan rangkap, hingga ikatan siklo bisa digambar dengan mudah menggunakan aplikasi ini.

Bagi para ilmuwan, atau pekerja laboratorium, mahasiswa, pelajar, ataupun pengajar sains saya sarankan menggunakan aplikasi ini. Bisa diekspor dalam format PDF, sehingga bisa disalin di dokumen yang lain.

Terimakasih Semoga dapat bermanfaat :)

Tutorial Aplikasi ChemSketch Dalam Pembelajaran Kimia

  ChemSketch

 

Penggambaran struktur molekul menurut Lewis (aka struktur Lewis) merupakan gambaran yang masuk akal yang bisa diterima selama ini. Visualisasinya biasanya menggunakan dot atau tanda x atau yang lain, juga boleh menggunakan variasi warna. Tujuan penggambaran ini hanyalah untuk memudahkan siapa saja yang ingin memahami struktur atom atau molekul.

Jika ingin mengambarkan struktur Lewis secara manual tidaklah sulit. Namun pada saat menuliskan/menggambar dengan program olah kata itu akan menyulitkan. Oleh karena itu akan lebih mudah kalau menggunakan perangkat lunak pendukung yang khusus. Misalnya dengan menggunakan Chemsketch.

Penggunaan ChemSketch untuk menggambar struktur Lewis sangat mudah. Di situ sudah tersedia beberapa model dan kita bisa menambahkannya sendiri sehingga pada saat diperlukan kita tinggal klik saja.

Cara menggambar struktur Lewis:

1.      Buka ChemSketch: Klik Start-> Program -> ACDLabs 12 -> ChemSketch

2.      Klik F5 atau klik menu Template -> Template Windows

 

3.      Pilih model struktur Lewis yang sesuai dengan meng-klik-nya dan kemudian klik pada area kerja ChemSketch. Misalnya saya pilih struktur Lewis dari CH4.

 

4.      Pindahkan dari mode Structure ke mode Draw agar struktur Lewis tadi bisa dikopi

5.      Klik struktur Lewis tadi kemudian kopi dengan Tombol Ctrl + C atau klik Edit -> Copy

6.      Buka pengolah kata yang biasa anda pakai.

 

7.      Letakkan (paste/rekat) pada posisi di mana anda akan meletakkan struktur Lewis kemudian Ctrl+V atau klik menu Edit -> Paste pada pengolah kata tadi.

8.      Lakukan hal yang sama untuk struktur Lewis lainnya.

Bagaimana kalau kita ingin menambah model Lewis yang tidak tersedia di Template-nya ChemSketch?
Berkas (file) untuk template ini sebenarnya terletak pada c:\program files\acdfree12\template\. Kita bisa memodifikasi dan membuat sendiri template yang belum tersedia. Untuk menambah atau memodifikasi template yang ada.

1.      Buat model struktur lewis secara manual pada mode Draw. Gunakan atau aktifkan Tool Edit Texts yang berada tepat di bawah tulisan Draw. Mulailah menggambar struktur Lewis satu persatu dan dengan menggunakan beberapa template yang tersedia (seperti dot dll). Setelah selesai menggambar itu lakukan grouping dengan klik menu Object dan pilih Group. Jangan lupa sebelumnya seleksi semua gambar tadi. Untuk mengkopi bagian tertentu praktis (tekan tombol Ctrl sambil men-drag apa yg akan dikopi kemudian meletakkan di sisi lain.

2.      Setelah selesai pada menu Templates klik Save User Template…

 

3.      Isikan nama template dan tempat penyimpanan template yang anda buat pada folder tertentu.

4.      Template siap digunakan dan secara otomatis ada dalam jendela template windows.

 

T     Terimakasih, Semoga dapat bermanfaat :)

Tutorial Aplikasi Chemix Dalam Pembelajaran Kimia

 Chemix

Fitur yang disediakan antara lain

• Ø Tabel sistem periodik beserta keterangan detail tiap unsur.
• Ø Bisa menentukan senyawa berdasarkan spektroskopi senyawa tersebut.
• Ø Kamus khusus kimia
• kalkulator
• unit konversi panjang, berat, tekanan, daya, temperatur, dsb.
• Ø Menghitung persamaan gas gay lussac.
• Ø Menampilkan 3d dari molekul.
• Ø Menghitung dan menggambar kurva persamaan diagram fasa 3 maupun 2 fasa / lebih. Cocok untuk mata kuliah kimia fisika.
• Ø Menghitung persamaan kurva serta menggambar kurvanya.
• Ø Menghitung asam basa serta pkw, pka, ph, poh dan pkb.
• Ø Menampilkan kelarutan tiap senyawa/ solubility chart.
• Ø Menghitung kelarutan.
• Ø Elektrokimia.
• Ø Kalkulator molekul
• Ø Termokimia.
• Ø Menghitung stoikiometri senyawa.

Screenshotnya

Tutorial penggunaan chemix adalah sebagai berikut :

Menambahkan & Menyeret

Untuk menambahkan aparat, pilih item dari toolbar atas . Untuk mengubah kategori, klik pada tombol berlabel kecil di setiap sisi toolbar. Saat ini, ada 5 kategori dengan 8 item per setiap. Setelah menambahkan item, muncul di ruang kerja. Untuk tarik ke tempat yang tepat, cukup klik dengan mouse kiri, drag dan kemudian lepaskan. Anda hanya dapat menarik satu item pada suatu waktu, multiselection tidak didukung.

Menggunakan Editor

Untuk memutar atau mengubah gaya item, tarik ke alun-alun berlabel ’sensor’ sampai lampu merah pergi hijau. Tekan panah untuk memutar item, tekan tombol bintang untuk mengubah gaya. Tidak semua item mendukung perubahan gaya.

Menghapus

Untuk menghapus item, menyeret mereka sampah. Untuk menghapus beberapa item, Anda dapat menarik bin (dengan mengklik bar bagian atas di atas tempat sampah) atas barang-barang Anda. Setiap barang yang bersimpangan dengan sampah, akan dihapus.

Memunculkan tabel

Untuk menghentikan pengaturan aparat dari ’melayang’ di udara, klik tombol kiri bawah untuk menampilkan tabel. Klik lagi untuk menyembunyikannya.

Finishing

Sayangnya Chemix tidak memungkinkan Anda untuk menyimpan atau mengekspor pekerjaan Anda menjadi sebuah gambar, namun Anda hanya dapat mengambil screenshot, menghapus semua toolbar dan item UI dalam program cat dan kemudian paste gambar yang dihasilkan di tempat yang diinginkan. Chemix memiliki banyak sekali fitur.

Dalam mata pelajaran ikatan kimia chemix banyak memberi kemudahan antara lain untuk mengetahui jari-jari kovalen suatu senyawa, untuk mengetahui besarnya keelektronegatifan suatu unsur sehingga memudahkan untuk mengetahui kepolaran suatu senyawa kovalen berdasarkan perbedaan harga keelektonegatifannya. Serta berguna juga untuk mengetahui struktur kristal atom.

Periodic Table

Periodic table - graphics

Periodic table - properties

Terima kasih dan selamat mencoba :)

Tutorial Aplikasi GCHEMPAINT Dalam Pembelajaran Kimia

GCHEMPAINT 

Satu lagi software kimia dalam Linux adalah Gchempaint. 

Yuk kenalan dengan Gchempaint.

Apa itu Gchempaint?

GChempaint (kimia Editor struktur 2D untuk desktop GNOME2) GChempait adalah aplikasi untuk yg mirip Artikel Baru Xdrawchem, namun ditambah kemampuannya untuk membuat dokumen dengan berbagai antarmuka. Gambar berbagai molekul hasil dari GChempaint ini dapat disearch pada NIST Webbook dan PubChem.

GChempaint memiliki tools seperti di bawah ini:

Nah anda dapat berkreasi sepuasnya dengan tools tersebut.

selamat mencoba teman-teman,, 

semoga bermanfaat ya

Tutorial Aplikasi GElemental Dalam Pembelajaran Kimia

GElemental

GElemental sebenarnya merupakan aplikasi yang dapat dipasang pada setiap sistem operasi Linux. Menurut saya GElemental atau dengan nama sedikit beda GElemental namun tampilannya lebih bagus.

Tapi kali ini saya membahasannya setelah saya mencoba menggunakan ChemPup dalam Puppy Linux. Seperti halnya aplikasi yang menyajikan tabel periodik tentu akan memberikan informasi sedatail mungkin dengan tampilan yang sangat menarik. Tak terlalu banyak lebih-nya pada aplikasi yang satu ini.

Pada GElement ini kita bisa melihat properti terkait unsur masing-masing mulai dari informasi yang tergolong umum, sifat fisik, maupun sifat atomiknya.

Dari tabel ini kita juga bisa menelusuri lebih lanjut mengenai sumber yang dijadikan patokan pemberian nilai-nilai variabel sifat.

Berikut ini adalah screenshoot tampilan GElemental model list, bukan dalam bentuk tabel seperti yang terlihat pada gambar-gambar sebelumnya. Kita bisa mengurutkan berdasarkan header tabel list yang ada juga bisa melihat sifat berdasarkan sifat umum (general), sejarah, sifat fisik, sifat termal, sifat atomik, bentuk kristalografik, elektronik dan sebagainya.

Aplikasi ini sangat cocok digunakan mengajarkan materi yang terkait sengan sistem periodik, struktur atom dan kimia unsur.

Meskipun saya belum mendapatkan yang dapat dipasang di sistem operasi windows, softaware serupa sudah banyak tersedia, baik dalam bentuk flash maupun web atau yang harus diinstall terlebih dahulu.

Terimakasih semoga dapat bermanfaat :)

Tutorial Aplikasi Hyperchem Dalam Pembelajaran Kimia

CARA MEMBUAT BENTUK MOLEKUL DENGAN HYPERCHEM

Ini adalah alternatif untuk membuat bentuk molekul sendiri selain yang pernah saya bahas di sini (menggunakan Chemsketch).

Hyperchem adalah salah satu aplikasi kimia komputasi yang relatif mudah untuk digunakan karena sifatnya yang langsung bisa menunjukkan tampilan dari apa yang hendak kita buat. Meskipun demikian ini hanyalah sekelumit tentang kemampuan Hyperchem yang bisa dimanfaatkan dalam pembuatan media belajar yang sederhana namun secara komputasi kimia dibenarkan. Tentu saja kalau semua kita lakukan dengan benar, tidak asal gambar, seperti sebelum menggunakan software layaknya Hyperchem ini.

Oh yah bagi yang ingin mengunduh Hyperchem versi demo atau produk evaluasi bisa mengunduhnya dari sini. Jangan lupa daftar untuk bisa mengunduhnya 

Ok kembali ke tujuan semula, saya akan praktikkan menggambar molekul PCl5 menggunakan Software Hyperchem 8.

1. Dengan menggunakan Windows, kita mulai dari klik Start, All Program, Hyperchem Release x, Hyperchem.
2. Selanjutnya ikuti langkah pada gambar berikut.
3. Ini hasilnya setelah dipilih Atom P dan di-klik-kan pada area kerja. 
4. Berikutnya add hidrogen dari menu Build kemudian klik Add hidrogen untuk memunculkan atom H, meskipun atom H tampilannya bertumpuk kita bisa memutar dengan klik tool rotate out of plane sesuai langkah yang terterah pada gambar. Cara menyeleksi atom H yang akan diganti dengan Cl adalah dengan klik tool select hingga berubah warna. 
5. Selanjutnya ubah atom H dengan atom Cl hingga atom H menjadi Cl, caranya klik menu Build, Default Element (akan muncul semacam tabel periodik dan pilih Cl), klik-kan tepat di tengah bulatan seleksi atom H tadi, kalau sudah berubah menjadi Cl artinya sudah terganti H menjadi Cl. Lakukan pada semua H sebagaimana yang diinginkan. 
6. Lakukan optimasi geometri agar bentuk molekulnya menjadi benar secara kimia komputasi dengan standar hitungan dengan menggunakan salah satu metode, misalnya di sini saya gunakan metode Molecular Mechanic. Klik menu Setup pada menu bar. Klik Molecular Mechanic hingga tercentang terus klik Ok.
7. Selanjutnya kita lakukan optimasi geomteri terhadap bentuk molekul yang kita buat. Klik menu Compute, KlikGeometry Optimation… dan klik Ok saja begitu menu pop-up muncul. Selanjutnya tunggu hingga proses optimasi selesai yang ditandai dengan Converged = YES. (ini ada pada bagian status bar, terletak dibagian bawah layar kerja Hyperchem. 
8. Berikut kalau kita ingin menampilkan hasil dalam berbagai model, seperti yang ditawarkan pada menuDisplay, Rendering, pilih metode rendering yang kita inginkan. 
9. Berikut tampilan beberapa hasil rendering: