SELAMAT DATANG KAWAN

SELAMAT DATANG DI BLOG PEMBELAJARAN KIMIA BERBASIS ICT

Jumat, 28 November 2014

Tutorial Aplikasi GDIS Dalam Pembelajaran Kimia

GDIS(Graphical Display Interface for Structures)

GDIS (Graphical Display Interface for Structures) adalah program visualisasi ilmiah untuk manipulasi, display, dan analisis molekul terisolasi dan struktur periodik. Hal ini dalam pengembangan, tapi tetap cukup fungsional. Ini memiliki fitur berikut:
  • Dukungan untuk banyak format file umum (CIF, PDB, XTL, XYZ, dan banyak lagi).
  • Job pengajuan alat untuk paket kimia komputasi: GAMESS, Gulp, ReaxMD, dan SIESTA.
  • Job analisis dan alat grafik untuk simulasi dinamika.
  • Berguna manipulasi alat, termasuk matriks transformasi dan konstruksi supercell.
  • Permukaan yang kuat dan alat generasi kristal morfologi.
  • Pola difraksi generasi dan merencanakan.
  • Animasi multi-frame file.
  • Aneka alat untuk visualisasi (pengukuran, pita, layar polyhedral).
Berikut akan saya jelaskan beberapa langkah penggunaan aplikasi GDIS ini. disini saya akan menggunakan contoh sederhana yakni dengan membuat molekul air (H2O) dengan aplikasi ini. langkah-langkahnya adalah sebagai berikut.
Seperti biasa buka aplikasi GDIS, dimana tampilan awalnya akan seperti berikut :
Screenshot from 2012-12-31 06_14_52
Klik pada ikon new model untuk membuat model baru,
Screenshot from 2012-12-31 06_16_28
Pada kolom model pilih model : editing,
Screenshot from 2012-12-31 06_20_19
Pada bagian label ketik nama atom yang akan digunakan, kemudian klik pada bagian Add atoms dan klik pada jendela gambar, maka atom akan muncul. Pada penjelasan kali ini saya akan membuat molekul air sehingga saya akan membuat dua atom H dan sebuah atom O.
Screenshot from 2012-12-31 06_20_44
Berikutnya untuk membuat ikatan antar atom diatas, klik Add bonds dan klik salah satu atom dan tarik ke atom lainnya dan molekul air pun selesai kita buat…
Screenshot from 2012-12-31 06_22_04
Pada aplikasi ini disediakan beberapa jenis tampilan molekul, seperti pada aplikasi kimia lainnya dan untuk memilih tampilan yang diinginkan dapat kita lihat dengan memilih Display pada bagian model seperti pada gambar berikut ini.
Screenshot from 2012-12-31 06_22_53
Klik sesuai dengan keinginan mka secara otomatis bentuk molekul akan berubah-ubah sesuai pilihan anda. :)
Menggunakan Tool Measurements
Dengan aplikasi GDIS kita dapat melakukan berbagai pengukuran seperti ikatan, jarak antar atom, serta sudut ikatan dari molekul yang kita buat. Caranya adalah klik ikon measurements. Maka akan muncul tampilan seperti berikut :
Screenshot from 2012-12-31 06_27_54
Klik pada tab search kemudian pilih parameter apa yang hendak kita ukur (Bonds, Distances, Intermolecular, Bond Angles, atau Angles) kemudian klik search. Maka pada label list akan muncul nilai nilai dari pengukuran.
Screenshot from 2012-12-31 06_29_09
Tool Animation
Dengan tool animation ini kita dapat merekam aktifitas kita dalam melakukan pengamatan ataupun membuat suatu molekul bahkan kita juga bisa menyimpannya dalam bentuk gambar dengan format .gif ataupun video. Untuk menggunakannya klik ikon Animation maka akan muncul tampilan berikut :
Screenshot from 2012-12-31 06_36_16
Klik pada tab rendering, beri centang pada bagian make movie, pilih jenis file keluaran dan isikan nama filenya kemudian close, maka kegiatan anda pada jendela gambar akan terekam.
Selanjutnya untuk memutar kembali hasil kegiatan anda, klik kembali ikon Animation lalu pada bagian bawah klik play dan kegiatan anda kan diputar..  :)
Screenshot from 2012-12-31 06_36_55
Inilah Sekilas Penjelasan mengenai tutorial aplikasi GDIS.. Semoga dapat bermanfaat untuk anda..
Terimakasih :)

Tidak ada komentar:

Posting Komentar